Analyse phylogénétique et Génomique comparative d’une souche de Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum R5 à potentiel anti fongique / OTMANI Feryel

Public ISBD Titre : Analyse phylogénétique et Génomique comparative d’une souche de Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum R5 à potentiel anti fongique Type de document : texte imprimé Auteurs : OTMANI Feryel, Auteur ; AZOUAGH Wissem, Auteur Année de publication : 2023/2024 Importance : 54p. Présentation : ill. Format : 30 cm. Accompagnement : CD. Langues : Français (fre) Tags : PGPR  Bacillus amyloliquefaciens subsp  Plantarum–MEGA 11  CGVIEW  ORTHOVENN3  ANTISMASH  BGC. Résumé : Les bactéries PGPR (Plant Growth-Promoting Rhizobacteria) présentent un intérêt majeur pour une agriculture durable, en permettant de promouvoir la croissance des plantes tout en réduisant l'utilisation d'intrants chimiques coûteux et polluants. Ce travail vise à caractériser une souche de Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum nommée R5 en tant que PGPR, à travers une étude in silico et in vitro, et à évaluer son potentiel antifongique. L'analyse phylogénétique réalisée avec MEGA11 montre que la souche R5 est affiliée aux espèces B. siamensis (98,78%), B. velezensis (98,78%), B. subtilis (98,62%) et B. amyloliquefaciens (98,54%), avec un bootstrap de 65%. La cartographie génomique via CGview révèle la présence de gènes codant pour des métabolites secondaires antifongiques comme les fengycines et les iturines. L'outil antiSMASH identifie des clusters de gènes de biosynthèse (BGC) confirmant la capacité de R5 à inhiber divers phytopathogènes. L'analyse comparative des génomes par OrthoVenn3 montre une similarité de séquence de 75% entre R5 et NRRLB-41580, légèrement inférieure avec FZB42 (68,85%) et plus faible avec KACC13105 (61,90%). Les tests in vitro démontrent que la souche R5 présente une activité antifongique avec un taux d'inhibition d'environ 64% contre le phytopathogène Aspergillus niger. Ces résultats soulignent le potentiel de B. amyloliquefaciens. R5 en tant que PGPR et agent de biocontrôle, ouvrant la voie à des applications pratiques dans une agriculture plus durable. Encadreur : SELAMI.N Examinateur : AIBECHE.C Analyse phylogénétique et Génomique comparative d’une souche de Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum R5 à potentiel anti fongique [texte imprimé] / OTMANI Feryel, Auteur ; AZOUAGH Wissem, Auteur . - 2023/2024 . - 54p. : ill. ; 30 cm. + CD. Langues : Français (fre) Tags : PGPR  Bacillus amyloliquefaciens subsp  Plantarum–MEGA 11  CGVIEW  ORTHOVENN3  ANTISMASH  BGC. Résumé : Les bactéries PGPR (Plant Growth-Promoting Rhizobacteria) présentent un intérêt majeur pour une agriculture durable, en permettant de promouvoir la croissance des plantes tout en réduisant l'utilisation d'intrants chimiques coûteux et polluants. Ce travail vise à caractériser une souche de Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum nommée R5 en tant que PGPR, à travers une étude in silico et in vitro, et à évaluer son potentiel antifongique. L'analyse phylogénétique réalisée avec MEGA11 montre que la souche R5 est affiliée aux espèces B. siamensis (98,78%), B. velezensis (98,78%), B. subtilis (98,62%) et B. amyloliquefaciens (98,54%), avec un bootstrap de 65%. La cartographie génomique via CGview révèle la présence de gènes codant pour des métabolites secondaires antifongiques comme les fengycines et les iturines. L'outil antiSMASH identifie des clusters de gènes de biosynthèse (BGC) confirmant la capacité de R5 à inhiber divers phytopathogènes. L'analyse comparative des génomes par OrthoVenn3 montre une similarité de séquence de 75% entre R5 et NRRLB-41580, légèrement inférieure avec FZB42 (68,85%) et plus faible avec KACC13105 (61,90%). Les tests in vitro démontrent que la souche R5 présente une activité antifongique avec un taux d'inhibition d'environ 64% contre le phytopathogène Aspergillus niger. Ces résultats soulignent le potentiel de B. amyloliquefaciens. R5 en tant que PGPR et agent de biocontrôle, ouvrant la voie à des applications pratiques dans une agriculture plus durable. Encadreur : SELAMI.N Examinateur : AIBECHE.C

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Code-barres	Cote	Support	Localisation	Section	Disponibilité
4149	03BGV-20-100	version papier et numérique	Bibliothèque de la faculté S.N.V * HARCHE MERIEM*	B.G.V	Disponible

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