Catalogue des thèses doctorat et mémoires Master par spécialité-FSNV
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| Titre : |
Analyse in silico du gène ctxB de la bactérie Vibrio cholerae |
| Type de document : |
texte imprimé |
| Auteurs : |
Ziar Fatima Zohra, Auteur ; Zeghar Maroua, Auteur |
| Année de publication : |
2023/2024 |
| Importance : |
81 p. |
| Présentation : |
ill. |
| Format : |
30 cm |
| Accompagnement : |
CD |
| Langues : |
Français (fre) |
| Tags : |
Choléra Vibriocholerae Etude in silico Gène ctxB MEGA11 GenBank |
| Résumé : |
Le choléra est une maladie dévastatrice et parfois mortelle causée par un bacille à Gram négatif, Vibrio cholerae. L’objectif de notre étude est d’analyser in Silico le gène ctxB de cette bactérie pathogène à partir de la base de données Genbank.
L’analyse est basée sur une étude phylogénétique des séquences protéiques et nucléotidiques, la p-distance et la composition des acides aminés.
Les résultats ont montré que cette maladie a touché plusieurs continents du monde, mais plus précisément le continent asiatique. L’analyse des séquences protéiques du gène ctxB des 47 souches de V.choleraeétudiées a révélé une similarité avec une p-distance faible (entre00 et 0.088).
L’alignement des séquences protéique a montré que les séquences partagent presque les mêmes acides aminés, contenant peu de variations.
L’analyse phylogénétique des séquences nucléotidiques et protéiques a regroupé les différentes souches de V.cholerae en clusters proches avec des bootstraps élèves. L’étude in Silico réalisé a confirmé l’existence de liens entre les pandémies de choléra à travers le monde, indiquant qu’elle a été transmise dans de nombreux pays. |
| Encadreur : |
Beghalem.H |
| Examinateur : |
Sad Houari.N |
Analyse in silico du gène ctxB de la bactérie Vibrio cholerae [texte imprimé] / Ziar Fatima Zohra, Auteur ; Zeghar Maroua, Auteur . - 2023/2024 . - 81 p. : ill. ; 30 cm + CD. Langues : Français ( fre)
| Tags : |
Choléra Vibriocholerae Etude in silico Gène ctxB MEGA11 GenBank |
| Résumé : |
Le choléra est une maladie dévastatrice et parfois mortelle causée par un bacille à Gram négatif, Vibrio cholerae. L’objectif de notre étude est d’analyser in Silico le gène ctxB de cette bactérie pathogène à partir de la base de données Genbank.
L’analyse est basée sur une étude phylogénétique des séquences protéiques et nucléotidiques, la p-distance et la composition des acides aminés.
Les résultats ont montré que cette maladie a touché plusieurs continents du monde, mais plus précisément le continent asiatique. L’analyse des séquences protéiques du gène ctxB des 47 souches de V.choleraeétudiées a révélé une similarité avec une p-distance faible (entre00 et 0.088).
L’alignement des séquences protéique a montré que les séquences partagent presque les mêmes acides aminés, contenant peu de variations.
L’analyse phylogénétique des séquences nucléotidiques et protéiques a regroupé les différentes souches de V.cholerae en clusters proches avec des bootstraps élèves. L’étude in Silico réalisé a confirmé l’existence de liens entre les pandémies de choléra à travers le monde, indiquant qu’elle a été transmise dans de nombreux pays. |
| Encadreur : |
Beghalem.H |
| Examinateur : |
Sad Houari.N |
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Exemplaires (1)
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| 10071 | 03MICRO-20-071 | version papier et numérique | Bibliothèque de la faculté S.N.V * HARCHE MERIEM* | MICROBIOLOGIE | Disponible |
